Далее полученную бражку подвергают очистке на стадии дистилляции (перегонка, испарение жидкости с последующим охлаждением и конденсацией паров), оснащённой двумя колоннами, для достижения требуемой концентрации и чистоты спирта. В итоге получается спирт концентрацией 96%. Для достижения крепости спирта в 99,8% его обезвоживают на колоннах с молекулярными ситами. На стадии дистилляции образовывается основной отход производства биоэтанола – послеспиртовая барда (сухой остаток), которая перерабатывается для получения DDGS (Dried Distillers Grains with Solubles - сухая обогащённая барда), кормовых дрожжей или биогаза.
Изучим технологию «мокрого» способа производства биоэтанола. При использовании этого способа сначала размалывается зерно, затем полученная мука смешивается с водой, и эта пульпа (смесь твёрдых частиц и жидкости) подвергается агломерации (объединение) с последующей трехфазной сепарацией: при этом выделяются клейковина, крахмал А (идёт на получение сухого крахмала и карамельной патоки), крахмал Б требуется для выделения белков, клетчатки, ди- и моносахаров, полисахаридов. Последние ещё и осахариваются ферментами до простых сахаров. Итоговое сусло сбраживается, и образуется этанол. Далее идёт дистилляция и ректификация (разделение жидких смесей на практически чистые компоненты, различающиеся температурами кипения, путём многократного испарения жидкости и конденсации паров). Барда сепарируется (разделяется). Жидкая фракция упаривается и смешивается с твердой фракцией. После чего эту смесь высушивают и получают сухую барду – кормовой продукт.